Fernando Reinares es catedrático de Ciencia Política y Estudios de Seguridad en la Universidad Rey Juan Carlos e investigador asociado distinguido del Real Instituto Elcano. Wilson Center Global Fellow y Adjunct Professor de la Universidad de Georgetown en Washington. Es también Fellow del GWU Program on Extremism y Senior Associate Research Fellow del ISPI en Milán.

Fue investigador del Instituto Universitario Europeo en Florencia, Fulbright Scholar en la Universidad de Stanford y Fellow del St. Antony¿s College en Oxford. Profesor visitante en la Universidad de Carolina del Norte, el Instituto de Estudios Políticos de París, la Universidad Cattolica del Sacro Cuore en Milán, el Center of Excellence Studies on Terrorism and Responses to Terrorism, Universidad de Maryland, o el Program on Terrorism and Homeland Security de American University. Ocupó una cátedra Jean Monnet en la UNED (1991-1999) antes de convertirse en 2000 en catedrático de la Universidad de Burgos.

Primer Presidente del Grupo de Expertos en Radicalización Violenta de la Comisión Europea (2007-2009) y antes asesor para asuntos de política antiterrorista del ministro del Interior (entre mayo de 2004 y abril de 2006, siendo titular de la cartera José Antonio Alonso), periodo durante el cual trabajó en la adaptación de las estructuras de seguridad interior frente a la amenaza del terrorismo yihadista. Ha recibido distintos premios y distinciones académicas como el Premio a la Excelencia Investigadora en Ciencias Sociales y Jurídicas que la Universidad Rey Juan Carlos (2016), la Cruz al Mérito Militar (2009) y la Cruz al Mérito Policial (2012). En 2016 es nombrado Riojano Ilustre, la máxima distinción que el Gobierno de La Rioja concede a personas. En 2021 obtuvo el Premio por la Memoria y la Paz que concede la Asociación 11-M Afectados del Terrorismo, y en 2022 el Premio Nacional de Criminología otorgado por la Sociedad Española de Investigaciones Criminológicas